Konsentrasi Jurusan Budidaya Perairan dibagi menjadi 3 Fokus Riset yaitu
- Reproduksi dan Endokrinologi Ikan Laut
Fokus Riset ini mengkaji tentang aspek-aspek yang berkaitan dengan proses reproduksi (induk – larva – benih) dan peran hormon dalam meningkatkan produktivitas hasil budidaya
2. Nutrisi dan Kesehatan Ikan Laut
Fokus Riset ini mengkaji tentang aspek Nutrisi, Pakan yang dibutuhkan untuk ikan tubuh dan berkembang, kesehatan ikan (parasit, bakteri, virus, jamur dll) dan pengaruh lingkungan terhadap ikan
3. Sistem Teknologi dan Bioteknologi Marikultur
Fokus Riset ini mengkaji tentang aspek teknologi-teknologi yang dibutuhkan dalam proses budidaya ikan laut dan bioteknologi yang dapat diterapkan pada ikan agar produktivitasnya meningkat.